Bazı gıdalar ve farklı diyet tipleri, bağırsaktaki canlı organizmaların sayısını ve sağlığını etkileyebiliyor. Probiyotikler, prebiyotikler, lif açısından zengin sebze ve meyveler, egzersiz, stresten uzak durmak ve yeterli uyku, bağırsak sağlığı için oldukça önemlidir. Tabi, bazı besinlerin fazla tüketimi ise bağırsak hastalıkları için risk faktörlerindendir.