Su böreğinin klasik iç harcında beyaz peynir ve maydanoz bulunur. Ancak dilerseniz kaşar peyniri, lor peyniri veya az tuzlu beyaz peynir de kullanabilirsiniz. Peyniri ufalayıp içine ince doğranmış maydanoz ekleyerek karışım hazırlayabilirsiniz.
Yufkalarınız hazır olduğunda, tepsinin tabanını tereyağı ile yağlayarak böreği kat kat dizmeye başlayabilirsiniz. Her katı tereyağıyla hafifçe yağlamak, su böreğinin lezzetini katlayacaktır. Peyniri orta katlara serpiştirerek böreğinizi tamamlayın. 180 derece fırında üzeri kızarana kadar yaklaşık 40-45 dakika pişirdikten sonra su böreğiniz servise hazır!