Eğer peyniri uzun süre saklamak istiyorsanız, dondurma yöntemi de bir alternatif olabilir. Ancak, peynir dondurulduğunda yapısında bazı değişiklikler meydana gelebilir. Bu nedenle dondurma işlemi, peynirin türüne ve kullanım amacınıza göre tercih edilmelidir. Dondurulmuş peynir, çözündükten sonra genellikle yemeklerde kullanıma daha uygundur, taze tüketim için pek uygun olmayabilir.