Çölyak hastalığı, (ince bağırsağın glutene karşı olan alerjisi) çoğunlukla demir eksikliği anemisi nedeniyle teşhis edilir. Bu semptomlar genellikle azaltılmış kan hacmi, nefes darlığı, yorgunluk, baş ağrısı, cildin solukluğu, mukoz zarı ve hatta eklem iltihabına bile yol açar. Gluten hassasiyeti ve bağırsakta oluşan demir eksikliğinden dolayı, demir sindirilmekte zorlanır.
Otoimmun hastalıklığına sahip olan birçok insanın gluten duyarlılığıyla ilgili bir geçmişi vardır. Çölyak hastalığı, içine gluten girdiğinde, kendi bağışıklık sisteminin bağırsak hücrelerine saldırmasıyla ortaya çıkan doğuştan gelen bir hastalıktır. Bu doğuştan gelen problem olduğu gibi diğer problemlere de yol açabilir. Örneğin; tiroit bezi iltihabı, diyabet vitiligo, eklem iltihabı ve doku sertleşmesi gibi sorunlar ortaya çıkabilir.