Endometriozisli hastalarda bu kistlerden gelen yumurtanın embriyo gelişimine bir etkisi bulunmamaktadır. Ancak endometriozisle birlikte başka bulgular da varsa embriyonun gelişimi etkilenebilmektedir. Bu gibi durumlarda endometriozis tedavisiyle birlikte tüp bebek başarısı artar.