Kabak çekirdeği, bolca magnezyum ve fosfor içerir. Ancak bu minerallerin fazla tüketimi vücuda fayda sağlamayacaktır. Bu minerallerin fazlası, vücutta elektrolit dengesizliğine yol açabilir. Yani kas krampları, kalp ritim bozuklukları gibi sorunlar yaşanabilir. Özellikle fazla fosfor, böbrekleri zorlayabilir.
Yeterli kalsiyum almadan aşırı fosfor tüketmek, kemiklerinize zarar verebilir. Yani, sadece bir kabak çekirdeği tüketerek kemikleriniz fark etmeden zayıflayabilir. Ayrıca kabak çekirdeği düşük glisemik indeksi ile kan şekeri üzerinde ani dalgalanmalara neden olmaz. Ancak farklı problemlerin ortaya çıkmasına yol açabilir.
Diyabet hastaları aşırı tüketim sonrasında dikkatli olmalıdır. Kan şekeri düzeylerini beklenmedik bir şekilde etkileyebilir. Aşırı kabak çekirdeği, yağlı yapısı nedeniyle mide asidini de artırabilir. Küçük ve lezzetli olsa da önerilen miktarın aşırısına kaçmamakta fayda var.